3.1 海水增养殖区环境状况
2009年，对全国66个海水增养殖区开展了水质、沉积物质量和生物质量综合监测。 水质状况 55%的海水增养殖区水质状况良好，各项监测指标符合第二类海水水质标准，比上年提高4%。影响增养殖区水质的主要原因是营养盐含量超标，部分重点增养殖区营养状态指数较高，水体呈富营养化状态，增养殖区及毗邻海域多次发生赤潮。
沉积物质量状况 52%的海水增养殖区沉积物质量符合第一类海洋沉积物质量标准，比上年降低3%。主要污染指标为粪大肠菌群、滴滴涕和铜等。
养殖病害发生状况 9个增养殖区发生了养殖病害，主要病害为白点病或缩曲症。发生病害的增养殖区主要有福建三沙湾、江苏如东、福建罗源湾、深圳南澳和福建闽江口等。 增养殖区综合环境质量状况 66个增养殖区环境质量综合指数评价结果表明，12%的增养殖区环境质量为“优良”，45%为“良好”，32%为“较好”，11%为“及格”。
2009年全国增养殖区环境质量状况*
* 环境质量综合指数（EQI）分级说明：
100～95：优良，环境质量状况均能满足功能区要求； 94～80：良好，环境质量状况能满足功能区要求； 79～65：较好，环境质量状况一般能满足功能区要求； 64～45：及格，环境质量状况基本能满足功能区要求； 44～0：较差，环境质量状况不能满足功能区要求。
2009年中国海洋环境质量公报
4 近岸海洋生态系统健康状况
2009年，国家海洋局继续对18个海洋生态监控区开展监测。18个监控区中有15个分布在国家沿海经济战略布局区域，共涉及21个海洋生态系统，主要类型为海湾、河口、滨海湿地、珊瑚礁、红树林和海草床等。监测内容包括环境质量、生物群落结构、产卵场功能以及开发活动等。
2009年全国海洋生态监控区基本情况
2009年海洋生态监控区生态系统健康状态
监测与评价结果表明，处于健康、亚健康和不健康状态的海洋生态系统分别占24%、52%和24%。我国近岸海洋生态系统面临的主要生态问题包括环境污染、生境丧失、生物入侵和生物多样性低等，这些问题在本世纪初已经显现，现在愈加突出。总体而言，我国近岸海洋生态系统健康状况恶化的趋势仍未得到有效缓解，生态保护与建设处于关键阶段。 污染压力居高不下 不健康和多数亚健康海洋生态系统仍然承受巨大的污染压力。2009年由陆源排污口排入生态监控区的污染物主要包括悬浮物、化学需氧量（CODCr）、营养盐、石油类和重金属。河口、海湾生态系统普遍受到营养盐污染，黄河口、长江口、珠江口、渤
