多重序列比对结果详见电子稿附件：VP7.aln文件
2. 在GeneBank数据库中检索10条SARS病毒Spike蛋白的氨基酸序列，使用CLUSTALX软件对这十条序列进行多重序列比对；
检索结果详见电子稿附件：Spike SARS.txt文件
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多重序列比对结果详见电子稿附件：Spike SARS.aln文件
3. 使用ClustalW软件或其他软件包构建上述DNA分子系统发生树。 三． 实验要求：
1. 提交使用CLUSTALX及PHYLIP软件进行多重序列比对及构建系统发生树的结果；
VP7 outtree:
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Spike of SARS outtree:
2. 总结多重序列比对及构建系统发生树的关键事项。
选择合适的比对算法，构建系统发生树时适当选择独立关系的分支序列。
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实验三 蛋白质结构分析及结构预测
一． 实验目的：
1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、了解蛋白质二级结构预测。
5. 学会运用结构浏览软件对生物大分子的结构进行观察。 二． 实验内容：
1. 使用Entrez或SRS信息查询系统检索水通道(Aquaporin-1, AQP1)蛋白质序列。
>gi|57163949|ref|NP_001009194.1| aquaporin-1 [Ovis aries]
MASEFKKKLFWRAVVAEFLAMILFIFISIGSALGFHYPIKSNQTTGAVQDNVKVSLAFGLSIATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISILRAIMYIIAQCVGAIVATVILSGITSSLPDNSLGLNALAPGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTDRRRRRDLGDSGPLAIGFSVALGHLLAIDYTGCGINPARSFGSSVITHNFQDHWIFWVGPFIGAALAVLIYDFILAPRSSDLTDRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK 2. 给出实例了解生物大分子结构数据库PDB中的记录方式，看懂记录中的内容并会运用Rasmol软件观察蛋白质的三维结构。
PDB文件1IH5.pdb的记录方式分析见附录。下图为在Rasmal软件中观察的结果：
球棒模型
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