人的B7H3蛋白3D建模

2026/4/28 21:20:55

从以上结果可以发现存在信号肽序列部分,三维建模时需要去除掉该段序列,即去除信号肽序列(MLRRRGSPGMGVHVGAALGALWFCLTGA)得到的处理序列如下: >human_b7h3_4ig

LEVQVPEDPVVALVGTDATLCCSFSPEPGFSLAQLNLIWQLTDTKQLVHSFAEGQDQGSAYANRTALFPDLLAQGNASLRLQRVRVADEGSFTCFVSIRDFGSAAVSLQVAAPYSKPSMTLEPNKDLRPGDTVTITCSSYQGYPEAEVFWQDGQGVPLTGNVTTSQMANEQGLFDVHSILRVVLGANGTYSCLVRNPVLQQDAHSSVTITPQRSPTGAVEVQVPEDPVVALVGTDATLRCSFSPEPGFSLAQLNLIWQLTDTKQLVHSFTEGRDQGSAYANRTALFPDLLAQGNASLRLQRVRVADEGSFTCFVSIRDFGSAAVSLQVAAPYSKPSMTLEPNKDLRPGDTVTITCSSYRGYPEAEVFWQDGQGVPLTGNVTTSQMANEQGLFDVHSVLRVVLGANGTYSCLVRNPVLQQDAHGSVTITGQPMTFPPEALWVTVGLSVCLIALLVALAFVCWRKIKQSCEEENAGAEDQDGEGEGSKTALQPLKHSDSKEDDGQEIA

通过SOSUI预测膜蛋白和跨膜区

通过Predict Transmembrane Topology (MEMSAT3 &

MEMSAT-SVM)预测膜蛋白和跨膜区(good !)

http://bioinf4.cs.ucl.ac.uk:3000/psipred/result/55013


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