斑马鱼的培养及TALENs技术的应用 - 图文

2026/1/18 5:31:41

中回收含 TALE repeats的DNA fragment;(回收产物可置于-20摄氏度保存)

酶连:将上述回收的两种DNA片段混合,加Solution I (TAKARA) or或者其他合适的DNA

连接酶

转化:将上述酶连后片段转入大肠杆菌体内

1)大肠杆菌感受态细胞的制备(老师提供则不需要此步)

1.从新活化的E.coli菌平板上挑取一单菌落,接种于5mL液体培养基中,37℃振荡培养

过夜,直至对数生长期。将该菌悬液以1:50接种于50mL LB液体培养基中,37℃快速振荡培养3~4h。

2.取5mL培养液放入离心管中,在冰上放置10min,于4℃5000rpm离心10min。 3.可用加样器将残余液体尽量去净,用1mL预冷的0.1mol/LCaCl2溶液轻轻悬浮细胞,

冰上放置15~30min。

4.于4℃,5000rpm离心10min。

5.弃上清,加入200μL预冷的0.1mol/LCaCl2溶液,小心悬浮细胞,冰上放置片刻,即

制成了感受态细胞悬液。

6.制好的感受态细胞可在冰上放置,24h内直接用于转化实验,也可加入占总体积95%

左右高压灭菌过的甘油,混匀后分装于Ep管中,-70℃条件下可保存半年至一年。 2)细胞转化

编号 样品 对照1 对照2 酶连产物 2 / 2 感受态细胞 100 100 / 无菌水 / 2 / 0.1mol/LCaCl2 / / 100 取200μL摇匀后的感受态细胞悬液,进行下一步的转化,转化如下(单位:μL): 将以上各样品轻轻摇匀,冰上放置30min后,于42℃水浴中保温90s,然后迅速在冰上冷却3~5min。上述各管中分别加入400μL LB液体培养基,使总体积为500μL,该溶液称为转化反应原液,摇匀后于37℃振荡培养30min,使受体细胞恢复正常生长状态,并使转化体产生抗药性。

取各样品培养液100μL分别接种于含氨苄青霉素和不含氨苄青霉素的LB平板培养基

—+

上(分别记为Amp和Amp),涂匀。37℃培养24h,待菌落生长良好且未相互重叠时停止培养。

提质粒:

1.取1.4mL菌液置于1.5mL Ep管中,7500rpm离心1min。

2.弃上清,加入150μL GET缓冲液,在涡旋混合器上充分混匀,在室温下放置10min。 3.加入200μL新配制的0.2mol/L NaOH(内含1%SDS),加盖,颠倒(不要振荡)2~3次,使之混匀,冰上放置4min,最多不能超过5min。

4.加入150μL冰冷的乙酸钾溶液。加盖后,颠倒数次使之混匀,冰上放置15min。 5.4℃,10000rpm离心5min,上清液吸至另一干净的1.5mL Ep中,如上清液浑浊则需重新离心一次。

6.于上清液中加等体积酚/氯仿液,振荡混匀,4℃,12000rpm离心2min,小心吸取上清液,转移至另一1.5mL Ep管中,注意勿将两液相中间的白色蛋白薄层吸出。

7.向上清液加入2倍体积无水乙醇,混匀,室温放置3min。用离心机于10000rpm离心5min。小心吸去上清液,将离心管倒置于一张纸巾上,以使所有液体流出。

8.用0.5mL 70%乙醇洗涤沉淀一次,10000rpm离心3min,除尽乙醇,室温自然干燥(将离心管倒置于一张纸巾上),备用。

9.用30uL含无DNA酶的胰RNase(20 ug/mL)的TE重新溶解DNA,置于4℃保存,供电泳检验使用。贮存于-20℃备用,可长期保存。

电泳(检测提取质粒是否成功) 1.琼脂糖凝胶的制备

称取o.21g琼脂糖,置于锥形瓶中,加入30mL TBE缓冲液,瓶口倒扣一小烧杯,于电炉上加热,注意:防止溢出,由于琼脂糖较难溶解,如果水分损失较大,则补充一定量的蒸馏水,使其终浓度为0.7%。 2.胶板的制备

将有机玻璃内槽洗净、晾干。取胶带纸将有机玻璃内槽的两端边缘封好,形成一个边脚模子。注意:将橡皮膏紧贴在有机玻璃内槽两端边上,不能留空隙。

将有机玻璃内槽置于水平位置,放好样品槽模板(一般称之为梳子),将冷却至65℃左

右的琼脂糖凝胶,小心地倒在内槽上,控制灌胶速度,使胶液缓慢地展开,直到整个有机玻璃板表面形成均匀的胶层。室温下静置1h左右,待凝固完全后,轻轻拔出样品槽模板,撕去胶带纸,胶板上即形成相互隔开的样品槽。

将有机玻璃内槽放入电泳槽中,加入0.5×TBE电泳缓冲液,以盖过胶板为宜。

胶板内的样品小槽

3.加样

用微量加样器将提取的质粒分别加入胶板的样品小槽内,每次加完一个样品为了避免交叉污染,各样品用不同的吸头,以免造成限制酶被污染。加样时,吸头不要插入胶板内,防止碰坏样品槽周围的凝胶面,每个样品槽的加样量不宜过多,本实验加样为10uL左右。(每块胶板需点一个Marker) 4.电泳

加完样品后应立即通电,进行恒压电泳。在低压条件下,线形DNA片段的迁移速度与电压成比例关系,为了获得电泳分离DNA片段的最大分辨率,电场强度不应高于5V/cm。

当溴酚蓝染料(蓝色)移动到距离胶板下沿约1~2cm处,停止电泳。 5.染色

将电泳后的凝胶浸入EB染液中,进行染色以观察在琼脂糖凝胶中的DNA带。染色30min后,用大量水冲洗。 6.观察

在波长为254nm的紫外灯下,观察染色后的电泳凝胶。DNA存在处显示出红色荧光条带。用凝胶自动成像仪处理代替。目标质粒大小约为3.1kb。 PCR:

(1)用记号笔在0.2mL PCR管上做好标记。

(2)准备冰盒,开始反应前尽量使PCR管保持在冰上。

(3)依次加入下列成分,配制25μL体系的PCR反应溶液: PCR pre-mix 12.5μL 引物1 1μL 引物2 1μL 提取的质粒 10μL 加无菌水至总体积25uL。 (4)轻弹管壁,混匀溶液。

(5)离心10s,使管壁上的液滴落下。 (6)按下列程序开始PCR反应: 94℃,1min ? 94℃,15s 68℃,15s

72℃,15 s 30个循环 ? 72℃,10min

?

4℃暂时放置,直至开始电泳

电泳:具体步骤同上,检验片段大小是否符合预期(约400多bp)。 测序:交由测序公司完成

3.2将TALE 重复序列与FokⅠ相连, 构建TALEN终载体并检验(本实验不要求做,了解原理即可)

用SpeⅠ和NheⅠ双酶切“组装好的TALE 重复序列载体pMD-TALE, 电泳后切胶回收备用。回收(n × 102)bp 大小的条带(n 表示pMD-TALE 载体中的TALE 重复单元数), 得到TALE 重复序列片段。将去磷酸化的pCS2 载体骨架与TALE 重复序列片段连接(见下图)、转化, 涂氨苄青霉素平板(Amp 抗性),37℃培养12 h,挑取单克隆菌落, 液体培养基培养,用SP6引物进行菌液PCR,测序验证TALEN序列是否正确。

图6 TALE 重复序列与FokⅠ相连,


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