锁图谱已经建成。高密度的分子连锁图谱对于基因定位、基因克隆及MAS意义重大。然而同其它农作物相比，果树的遗传连锁图谱饱和度及可用于MAS的标记数目还有待于增加。
以基因组作图为中心的基因组学发展很快。近几年又出现了一门新的学科——比较基因组学(Compar-ative mapping)。经研究证明：禾谷类物种之间基因组较保守，染色体上的基因顺序和含量有一定相似性，比较基因组学正是基于这样一种事实而发展起来的。比较基因组学为进化研究、饱和遗传图谱的建立、直向同源基因(Orthologus genes)基于图谱的克隆提供了有力手段，一旦某同源基因被克隆和测序，信息可很快用于其它植物上同源基因的克隆。随着不同实验室李属植物遗传连锁图谱的初步建立，作图的下一步要涉及到各图谱的比较和统一，目的在于产生该物种的较为完整的图谱。目前以桃的基因组克隆做探针在欧洲酸樱桃上研究表明：50％的桃的基因组克隆导致了欧洲酸樱桃RFLPs的产生，另外，桃第三个连锁群上紧密连锁的两个RFLP标记B4A9和B7A5在欧洲酸樱桃上也紧密连锁。以上研究结果无疑对李属乃至整个果树比较基因组的研究提供了良好的开端。
随着分子标记手段的不断更新和基因组图谱的日趋饱和，其应用也随之向深度和广度推进，分子生物学又出现了“功能基因组学”(Function genomics)和后基因组学(Post genomics)，主要是研究基因结构、表达和调控。随之而产生的DNA芯片技术(DNA chip)和信使RNA差异显示技术(Messenger RNA differentialdisplay，mRNA DD)为基因的定位、表达研究提供了崭新工具，相信在人类基因组计划的强大推动下，在水稻、小麦等农作物基因组研究的影响下，分子标记在果树的应用研究必将迎来一个迅速发展的时代。
——摘编自刘平、彭士琪、刘孟军、彭建营的文章
