HiSeq 数据上传流程 - 图文

2026/1/27 16:16:39

3、 数据上传

到这里,我们网页上的填写信息就完成了。利用NCBI中给的网址链接,账号和密码,我们就可以直接登录NCBI。

方法一:(该方法简单,但传输较慢)

打开我的电脑复制FTP网址进入,如图:

回车后界面(下面这真的是NCBI服务器的界面,如果你用过你们学校的服务器资源,FTP应该知道)

然后右键选择登录:

在里面输入NCBI给的账号和密码就可以进入NCBI服务器,即可打开远程FTP站点,

将需要上传的文件复制粘贴或者拖入其中即可开始上传。为了与其他提交者的文件进行区分,建议您在上传前,在该远程FTP站点上首先新建一个文件夹,并以区别于其他提交者的方式命名(建议使用BioProject编号命名),然后打开该文件夹,将数据上传到其中(Ctrl+C和Ctrl+V)。

方法二:(软件:FileZilla)

安装后打开的界面:本地站点为你的电脑,远程找点为服务器可视化界面

主机:NCBI给你的FTP链接,账号:sra 密码:NCBI给 端口:FTP数据传输默认为 21

登录:登录后只需要在右边右键创建一个文件并命名,然后在左边你的电脑上找到你要上传的的文件,从左边拖到右边文件夹里就OK了,接下来就等吧。

4、上传完成、检查状态。

登陆SRA提交页面,打开本次的Submission,可查看每一条SRA记录的状态。请您仔细检查上传的每一条记录是否Completed,是否所有的Sample、Experiment、Run信息对应无误。

另外还可以看到记录对应的Accession编号,编号主要有SRP、SRS、SRX、SRR分别对应Study、Sample、Experiment、Run。文章中可以根据上下需要引用这些编号。

如果您在在提交过程中遇到技术问题,您可以随时向SRA的工作人员寻求帮助。

上传完成后,在登录到SRA

进入sra结果:

百度帮助文档链接:

http://wenku.http://www.china-audit.com//link?url=Pys5SfWP2iKMRchrQjm8cR4hbDuFtS_k2DjiakY2EbBw-A-U3jfj3XdN93mLNN4HSwhefQxo24hrm7lnMH9cNLxcRQSSyvLP_BjsFaYIB2q

http://boyun.sh.cn/bio/?p=1922

http://www.plob.org/2012/08/25/3195.html

整理时间:5个小时。


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