real time PCR 操作手册

2026/4/27 17:23:48

(protocol)

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Real-time PCR 检测

实验流程描述:

收集生长状态良好的目的细胞,提取RNA,并反转录成cDNA采用real time PCR 方法检测 目的基因的表达情况。

实验材料:

1.主要试剂 REAGENTS Trizol M-MLV dNTPs oligo dT Rnase Inhibitor Primer(R&F) SYBR Master Mixture COMPANY Invitrogen 逆转录酶 promega 上海生工 promega 上海吉凯 TAKARA COMPANY Thermo 上海天能 TAKARA 公司 Cat.No 2000/2000C TP800 Cat.No. 15596-026 promega M1705 U1240 B0205 N2115 DRR041B 2. 主要仪器 EQUIPMENTS Nanodrop 分光光度计 稳压电泳仪 Real time PCR 仪器

实验步骤:

1 总RNA 抽提(根据Invitrogen 公司的Trizol 操作说明书进行)

1) 收集细胞,2000rpm 离心5min,去上清,细胞沉淀中加入1ml Trizol,充分混匀后室温静置5min,然后转移至新的1.5 ml EP 管中;

2) 每管加入200 μl 氯仿,用手上下颠倒eppendorf 管15s,室温静置10min; 3) 4℃,12800 rpm,离心10min;

4) 吸取上层液体移至新的1.5 ml EP 管,加入等体积预冷的异丙醇,混匀后4℃静置10 min; 5) 4℃,12800 rpm 离心10 min 后,弃上清;

6) 加入1 ml 75%乙醇(用DEPC水新鲜配制),洗涤沉淀;

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7) 4℃,11800 rpm 离心5 min,弃去大部分上清; 8) 4℃,11800 rpm 离心5 min,弃去上清;室温干燥;

9) 待RNA 沉淀基本透明时,加入RNase-free 水(加入体积视RNA沉淀量而定)至完全溶解,Nanodrop 2000/2000C分光光度计分析测定所抽提RNA 的浓度及质量。

2 RNA 逆转录获得cDNA(根据Promega 公司M-MLV 操作说明书进行)

实验所需耗材均购自Axygen,具体步骤如下:

1) 将1 μl Oligo dT(0.5μg/μl) 和2.0 μg Total RNA加入到PCR小管中,补充RNase-Free H2O至10ul;混匀后离心,70℃温浴10min;之后立即置于冰水混合物中冰浴,使Oligo dT 和模板退火;

2) 按下表的比例配制反应体系(冰上进行),混匀,短暂离心;

试剂 5×RT buffer 10mMdNTPs Rnasin(40U/ul) M-MLV-RTase(200U/ul) RNase-Free H2O 每管加入量 4 μl 2 μl 0.4 μl 1 μl 2.6 μl 注:dNTPs 是dATP , dCTP, dGTP, dTTP 的混合,浓度为10mM 3) 上述体系在42℃水浴反应1h,然后在70℃水浴10min 使RT 酶失活; 4) 将得到的RT 产物--cDNA 置于-80℃保存备用。

3 Real-time PCR 检测

1) 按下列比例配置反应体系:

试剂 SYBR premix ex taq: 上游引物(2.5μM) 下游引物(2.5μM) cDNA RNase-Free H2O 每管加入量 10.0 μl 0.5μl 0.5μl 1.0μl 8.0 μl 2)两步法进行Real-Time PCR,并制作熔解曲线,程序如下:

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4.数据分析

见实验报告

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